クラスタルX このアプリケーションは、DNAまたはタンパク質のための汎用のマルチシーケンスアラインメントプログラムを特徴としています。
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クラスタルX 説明

Clustal Xは、タンパク質およびDNAのための複数の配列アラインメントを扱う高度なプログラムです。 Clustalw用のGUIとして設計されている、プログラムは、適切な比較を実行するための多くのユーティリティも提供しています。ロード複数の特殊なフォーマットのプログラムは、次の形式のファイルからインポートされた準備完了シーケンスで機能することができます：embl / Swissprot、NBRF / PIR、Pearson（Fasta）、GCG / MSF（パイルアップ）、Clustal（* .Aln）、GCG9 / RSFおよびGDE。 輸入プロセス中、Clustal Xは、配列がヌクレオチドまたはアミノ酸であるかどうかを検出しようとしていますが、選択が正しいことになる実際の保証はありません。 ソースファイルがロードされている重要な要素ソースの巧妙に強調表示されている場合は、シーケンスアラインメントがプログラムのメインウィンドウに表示されます。内蔵の着色スキームは、保存された機能を強調表示するのに役立ち、それらを鮮やかな色でポップアウトさせます。 シーケンスの内容を区別するために、より大きなフォントを使用することをお勧めします。これにより、ズームされたシーケンスビューが発生し、その構成を簡単に見つけやすくなります。 簡単な整列プロセスプログラムによって許可されている操作はかなりリストを作ります。既存の整列にシーケンスを追加し、フラグメントをカットまたは貼り付けたり、文字列を検索したり、既存のギャップを削除したりできます。 また、次のいずれかの方法でアライメントを実行できます。 アラインメントプロセスを開始する前に、結果が決定されるために、すべてのパラメータ（新しいギャップ、タンパク質ギャップ）をリセットすることをお勧めします。 データを分析し、分析を示す最も重要な整列品質スコアを取得します。分析を示して、各列ごとに個別にプロットされているアライメント品質スコアです。ハイスコアはよく保存されたカラムを指定しますが、低保全レベルは低スコアで示されます。 結論には、分析はさまざまなパラメータによって異なります。これは、実行する必要がある科学的目的に従って設定する必要があります。最も間違いなく、プログラムは科学者のために最適な選択をしています。 Andrea Mateiによってレビューされ、最後に2014年7月21日に更新されました

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