グラインダー

ランダムアンプリコンとショットガンライブラリを生成するためのツール
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グラインダー ランキングとまとめ

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グラインダー 説明

グラインダーは、特定のエラープロファイルを持つ人工ショットガンおよびアンプリコンシーケンスライブラリを作成するためのオープンソースのバイオインフォーマットツールである。シミュレーションシーケンスプロジェクト(Flowsimのような)、メタグレン(Metasim)またはPyroTagデータセット(16S RDNA)。 特徴: *任意の読み取りと読み取り長さの配布 *さまざまなPCRのシミュレーションと配列決定誤差:キメラ、点突然変異、ホモポリマー *ランダムショットガンライブラリまたはアンプリコンライブラリ(例えば16代) *ペアエンドのショットガンデータセットを作成するためのサポート *特定のランク豊富さまたは手動で各ゲノムの存在量 *ゲノムを共有しない独立したデータセットの作成 *さまざまなゲノム長によって作成されたバイアスのモデリング *禁止されたキャラクター *アルファとベータダイバーシティ要件


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