コンパス ランキングとまとめ
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コンパス 説明
コンパス(シーケンス検索ソフトウェアの複雑なパターン)は、複雑な要素が存在するための全ゲノムを採掘することを可能にするシンプルで効果的なツールです。 このツールは、ユーザーフレンドリーで、柔軟で、リソース集約的で、全体のゲノム全体を分単位で閲覧することができます。 コンパスは、よく知られているWu-Manberのマルチパターンマッチングアルゴリズムを適用して、SEQUENTY全体のモチーフを徹底的に検索します。 入力要素は、(Blast Engineのように)単純な保存されたシーケンス、部分的にもしくは非常に縮退した配列、または劣った保存された可変長スペーサーによって結合された複数の縮退配列であり得る。 この小さなアプリケーションは、DAS、NCBI(データベース)またはバッチ以下の検索タイプを提供します。
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