シミリピド

前駆体と製品イオンのデータを使用して脂質を特徴付けるための包括的な情報学ツール...
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シミリピド ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Demo
  • 出版社名:
  • PREMIER Biosoft International
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 34.1 MB

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シミリピド 説明

脂質識別ソフトウェア、脂質の構造解明のための脂質MS、MS / MSおよびMSEデータを分析し、それらの同位体重複に対する実験的ピーク強度の補正。 プログラムは、テキスト、MS Excel、MzData、MZXMLおよびWatersのネイティブファイル形式（MSE）の質量分析によって得られた実験的MS、MS / MSおよびMSEデータ（M / Zおよび強度値）を受け入れる。ソフトウェアは、Simlipidデータベースで利用可能な既知の脂質構造に対して前駆体を検索することによって脂質の識別およびプロファイリングを可能にする。 LIPID ID、脂質略語、系統的名、組成および他のデータベースリンクなどの追加情報も簡単な参照のために利用可能にされています。 テストドライブのためにSimlipidを取って、それがすべて何を見るものを見る！ 主な特徴： 堅牢な脂質構造データベース： Simlipidデータベースは、8つの脂質カテゴリVizを含む大きなリレーショナルデータベースです。グリセロリン脂質、スフィンゴ脂質、脂肪アシル、グリセロ脂質、ステロール、プレノール、糖脂質および21905脂質種を有するポリケチド。他のデータベースリンクには、遺伝子およびゲノム（KEGG）、ヒトメタボロームデータベース（HMDB）、生物学的興味の化学的実体、Pubchem物質データベース、リピドバンク、およびリピダットの京都百科事典が含まれる。データベースは継続的に更新されています。カテゴリーVizからの脂質の理論的フラグメント。グリセロリン脂質、グリセロ脂質、プレノール脂質およびサッカロ脂質は、それらの理論的塊および対応する断片構造と共に入手可能である。 プロジェクト管理： SimLipIDは包括的なプロジェクト管理を提供し、脂質分析結果を入力プロファイルと検索パラメータと関連付けます。あなたは任意の数のプロジェクトを作成することができます。プロジェクトは、ソース、ラボ、または研究目標に基づいて分類することができます。 MS脂質検索： Simlipidは、スフィンゴ脂質、脂肪性アシル、グリセロ脂質、ステロール、プレノール、サッカロ脂質、ポリケチドおよびグリセロリン脂質のためにSimlipidデータベースで利用可能な既知の脂質構造に対して脂質前駆体イオンを探すことによって脂質プロファイリングを可能にする。ユーザーは、20ppmまたは2000ミリダルトン（MDA）以下のエラートレランスを持つ高解像度データのMS LIPIDサーチを実行できます。シミリピッドは、、、、、、、、、、負イオンモードにおける+ Cl]、、および。 SimLipIDは、簡単にそのような脂質データ分析を実行する直感的なユーザーインターフェースを提供します。 MS / MSおよびMSEデータを用いた脂質構造解明： Simlipidは、グリセロリン脂質、グリセロ脂質、プレノール脂質およびサッカロ脂質のMS / MSおよびMSEデータを使用して脂質の構造解明をサポートしている。特定された脂質は、実験データを用いて理論脂質の相対的な近接度を示す革新的なランキングアルゴリズムに基づいて選別される。 120分（ppm）、0.12000ミリガルトン（MDA）の間の誤差耐性を有する高解像度の正確な質量データを分析することができる。識別された脂質の二次元構造も表示されます。 脂質MSデータのハイスループット同位体ピーク補正： プロファイルの同位体補正は、生物学的混合物からの脂質の正確な定量を容易にするための必須のステップの1つである。 SimLipIDは、同位体パーセンテージを計算し、それらの同位体重複について観察された実験的ピーク強度を補正するためのハイスループットモジュールを提供します。補正された強度値は、スプレッドシート互換の.csvおよび.xlsファイル形式でエクスポートできます。 同定された脂質による質量スペクトル注釈 Simlipidは、MS、MS / MS、ならびにMSEデータについて同定された脂質を用いて質量スペクトルに注釈を付けることができる。これは、製品データベースからの理論上の脂質構造のものと一致する実験的M / Z値を強調することによって、マススペクトルを解釈するのに役立ちます。脂質の特徴付けの向上のために、各整合ピークは、脂質フラグメント名またはそれに対応する脂質化学式のいずれかで注釈を付けることができる。 注釈付きマススペクトルは、ページに収まるか、関心のある領域に基づいて調整/再サイズ変更することができます。ユーザーは、マウスカーソルを使用して、またはM / Z範囲を指定して特定のプロット位置にズームイン/ズームアウトできます。さらに、ユーザーは、MS PowerPointに含めることができる画像（PNGおよびJPEG形式）として注釈付きスペクトルをエクスポートでき、研究グループ間の情報共有を容易にします。 レポートを生成する： ユーザは、Labノートブック、出版物、または同僚との情報を共有するために実行されたSpreadSheet互換フォーマット.csvファイル、.xlsまたは.htmlファイルのいずれかで包括的なレポートを生成できます。 モジュールごとに、直感的なインターフェースは、ユーザーがレポートに含まれるであろう情報をカスタマイズすることを可能にします。 これは、MDA、PPMまたはDa、強度値、イオンモード、脂質略し、脂質のβDおよび分子構造のいずれかでM / Z、デルタ質量を含み得る。同位体パーセンテージおよび/または注釈付き質量スペクトルの計算後の補正強度値。 データベース検索： 脂質略語/一般名、質量、化学組成、または脂質IDによって興味のある脂質構造を検索することもできます。


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