ジェルゲル

プロテオミクスデータのシミュレーションと分析のためのソフトウェア
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ジェルゲル ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • Karsten Hiller
  • ファイルサイズ:
  • 33.7 MB

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ジェルゲル 説明

Jvirgelは、蛋白質の理論的等電点(PI)および計算された分子量(MW)を決定するように設計された強力な用途です。また、これらを仮想2次元(2D)タンパク質マップとして視覚化することもできます。ユーザは、興味のあるPI / MW範囲および電気泳動タイムスケールを選択することによって、計算された2Dゲルの提示を対話的に制御することができる。 主な特徴: Fasta、EmblファイルまたはXML を介したプロモリックデータベースからのアミノ酸シーケンスのインポート セクレーションの予測と可視化 膜プロテオームの予測と可視化 コドン適応指数(CAI)のプロテインスポットサイズへの翻訳 視覚化からの膜タンパク質の除外 シグナルペプチドおよびシリコの開裂の会計:PIおよびMW のより高い予測精度をもたらす PNG-またはJPG-Graphicsへの仮想ゲルのエクスポート 異なる回帰アルゴリズムを用いた実験用ゲルと仮想ゲルの一致 ユーザーが選択可能なPH / MWの範囲をズームする タンパク質はグループに分類でき、すべてのデータはCSVテーブルまたはMS-Excelスプレッドシートでエクスポートできます タンパク質は、それらの膜貫通ヘリックスの含有量またはそれらの分泌される可能性に従って着色することができる


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