スピンデルワークベンチ
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スピンデルワークベンチ 説明

スピンデルは、リボソームRNA（rRNA）遺伝子領域の長さに基づく生物学的同定のための代替的アプローチである。一般に、異なる種からの一次rRNA遺伝子配列のアラインメントは、ヌクレオチド置換（一般的に「SNP」と呼ばれる）および挿入/欠失（InDel）事象の観点から、ヌクレオチドの保存および変動の交互領域を示す。インディルズの存在は異なる長さのシーケンスをもたらし、典型的にはダッシュ「 - 」で表される整列にギャップを導入する。 生物学的同定のための私達の概念は以下のようにrRNA遺伝子配列を使用する：保存された領域は、シーケンス長の組み合わせが各種の特徴である可変セグメント（「スピンデル超可変領域」）を定義するために使用される（「スピンデルプロファイル」）。したがって、各種は固有の数値プロファイルによって定義することができます。 理論的には、20の対立遺伝子を持つ6つの超可変地域（またはそれぞれ5つの対立遺伝子を持つ11の地域）を持つわずか6つの超可変地域の調査は、すべての真核生物種を地球上で区別するのに十分です。実際には、スピンデルは、低分裂的変動および高い系統発生分解能で93.3％の真核生物種を識別することができます。

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