デッキ GPUの補正アルゴリズム
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デッキ 説明

GPU上の分散誤差訂正としても知られるDECGPUは、次世代シーケンス技術によって生成された短読のための並列分散誤差補正アルゴリズムである。 アルゴリズムは、CUDA C ++とMPIを使用して実装され、GPUまたはCPUクラスタ上で実行できます。 このアルゴリズムの並列的および分散機能は、計算オーバーヘッドからの課題を克服するために実現可能で柔軟性があり、大規模な ハイスループット短読データセット。 このアルゴリズムは、OpenMPIおよびMVAPICH2ライブラリーを備えたTELSA S1070クラスターでテストされています。

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