 | トランスポソンピタンパク質または核酸配列相同性を同定するための分析ツール |
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トランスポソンピ ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- Freeware
- 出版社名:
- transposonpsi.sourceforge.net
- 出版社のWebサイト:
- オペレーティングシステム:
- Windows XP/2000/98/Me/NT
トランスポソンピ タグ
トランスポソンピ 説明
Transposonpsi による編集は、転移要素の多様な家族によってコードされるタンパク質またはタンパク質との相同性を同定するための分析ツールである。 PSI-BLASTは、統計的に有意なアラインメントを同定するために（レトロ）トランスポゾンORFの相同性プロファイルの集まりと共に使用されます。 この方法は、タンパク質セット内の潜在的なトランスポゾンORFを同定するため、またはより大きなゲノム配列内のトランスポゾン相同性の領域を同定するために使用することができる。 これは、反復マッシュ剤および繰り返し要素の関連ヌクレオチドライブラリーを使用することによって、同定およびマスキングを脱出するゲノム配列内の縮重トランスポゾン相同性を同定することが特に有用である。 Transposonpsi は、原生動物、植物、菌類、および動物を含む真核生物を介した移動要素の発見を支援するために、ゲノム研究所で日常的に使用されてきました。
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