ピークファインダー酵母チップマイクロラリーデータにおけるピーク(付着結合部位)を配置する | |
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ピークファインダー ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- Free
- 価格:
- Free
- 出版社名:
- By Earl F Glynn
- オペレーティングシステム:
- Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows 98, Windows Me, Windows, Windows NT, Windows 7, Windows XP
- 追加要件:
- None
- ファイルサイズ:
- 11.6MB
- 総ダウンロード数:
- 189
ピークファインダー タグ
- ファインダ ロケータ ALTER PROTOCER BINDING. プロトコルバインディングを表示 プロトコルバインディング ピーク バインディングの選択 スキーバインディング バインディングを実装します Renderman Binding. 柔軟なバインディングメカニズム データバインディング 拘置 C ++からLUAの結合へ バインディングを作成します バインディングを生成します バインディングライブラリ QT 4バインディング .NET Binding. バインディングセット ツインピークスのスクリーンセーバー ツイン・ピークス OpenCL APIバインディング QTバインディング Pythonバインディング ピークを見つける ピークを見つける ピークロケーター クロマトグラフィーピークを見る クロマトグラフィーピーク分析 データベースAPIバインディング 三峰 j テキストモザイククリエーター 酸液滴1.0 N73着信音カッター Torブラウザをダウンロードしてください USBを安全に取り外します Adobe Acrobat5シリアル Nero Plugin Lame. PHPライター NRGファイル抽出器 sims3packボディショップ ユニバーサルイーサネットドライバー Bluetooth ドライバー IVT
ピークファインダー 説明
ピークファインダー塗布は、酵母チップ(クロマチン免疫沈降)マイクロラリーデータ中のピーク(コージン結合部位)を特定するツールであるように開発された。 PeakFinderは、「ピーク」のマイクロアレイ比データを検索するゲノム可視化ツールです。ピークは、相互作用的に選択できる平滑化曲線を使用して見出されます。指定された移動ウィンドウを使用したヌクレオチドコンテンツをマイクロアレイ結果とともに表示できます。プログラムはどのゲノムのほとんど一般的ですが、それでもいくつかの酵母のみのパラメータを持っています。 入力ファイル: - GenomeIndex.Datファイル:座標はゲノム内の各染色体の位置を語ります。セントロメアの場所も指定されています。 - 「機能座標」Excelワークシート:列A、B、Cは、名前、coord1、coord2でなければなりません。座標は各機能のゲノム座標です。 - マイクロアレイデータを備えた「比率」Excelワークシート:列Aは "iname"でなければなりません。比率データは最後の列にあると見なされます。機能 "iname"値は、機能座標ワークシートに指定されているものをマッハにする必要があります。 - ヌクレオチドシーケンスを持つディレクトリ、各染色体の1つのファイル。シーケンスデータは、Deflineを使用してFASTAフォーマット、または単にASCIIファイルを使用できます。ファイルの名前はChr *またはChrnn *でなければなりません。たとえば、Chr05.fsa、またはChrviii_562639.ascii。 Saccharomyces Genomeデータベースからの「古い」ファイル形式のいずれかが許容されます。 - PeakFinder.iniはディレクトリC:\DocumentsおよびSettings ローカル設定\Application Data\stowersinstitute\Peakfinderにあります。 出力ファイル: - ビットマップまたはメタファイルオプションが選択されている場合、チャートは自動的にクリップボードに配置され、表示後に他のアプリケーションにすぐに貼り付けることができます。 (自動保存チャートボックスをオフにすると、クリップボード上のチャートのこの自動配置が停止します。それ以外の場合は、チャートタブシートのボタンを押して、チャートを指定されたGIFファイルに保存します。 - Peaks Tabsheetのボタンを選択して、Peaks.csvファイルを保存することができます。これはExcelで開くことができます。 - RawData Tabsheetのボタンをクリックすると、生成されている一連のファイルが発生します。通常、新しいディレクトリを指定し、処理が完了したときにこれらのファイルを含みます。ratiofileName.dat、ratioFileName-chromosomenn.gif(Nn = 0116)、およびRatioFileName-Peaks.csv。ratioFileNameは比率Excelの名前です。 RAWデータタブシートに指定されたファイル。
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