 | ファースト高速タンパク質またはヌクレオチド比較用途 |
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ファースト ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- Free
- 価格:
- Free
- 出版社名:
- By 585Soft
- オペレーティングシステム:
- Windows 2000, Windows Vista, Windows 98, Windows Me, Windows, Windows NT, Windows 7, Windows XP
- 追加要件:
- None
- ファイルサイズ:
- 183.93K
- 総ダウンロード数:
- 168
ファースト タグ
ファースト 説明
FASTAは高速タンパク質またはヌクレオチドの比較に使用できる包括的なアプリケーションスイートです。 このプログラムは、高速での類似検索に対して高いレベルの感度を達成します。 これは、代替行列を使用して局所的な整列を最適化した検索を実行することによって達成される。 このプログラムの高速度は、最適化された最適化された検索を可能にする前に潜在的な一致を識別するために、観測されたワードヒットのパターンを使用することによって達成されます。 速度と感度の間のトレードオフは、単語のサイズを指定するKTUPパラメータによって制御されます。 KTUPを増やすと、背景ヒット数が減少します。 ヒットするすべてのワードが調査されているわけではありませんが、代わりに最初にいくつかの近くのヒットを含むセグメントを探します。
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