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APEは、小型で使いやすいプラズミド編集者であるように開発されました。 主な特徴： 編集ウィンドウの制限サイトをハイライトする 酵素サイトのダム/ DCMブロッキングを正確に反映する は、事前定義およびカスタム機能ライブラリを使用してテキストをハイライトします は、リアルタイムで選択したDNAの翻訳、TM、％GC、ORFを表示します。 DNAストライダー、FASTA、GenBank、EMBLファイルを読む ファイルをDNAストライダー互換またはGenBankファイル形式として保存します GenBankおよびEMBLファイルからの機能注釈を使用してグラフィックマップをハイライトして描画する は、NCBIまたはWORMBaseで選択されたシーケンスを直接爆破する テキストマップは、テキストベースのグラフィックスとしてのDNAシーケンス、翻訳、および機能を示しています はグラフィック制限マップを作成します - リニアまたは円形または円形の機能が示されています グラフィックとテキストの機能をハイパーリンクで接続します。ダブルクリック カプセル化されたPostScriptまたはスケーラブルベクトルグラフィックスとしてグラフィックを保存する Windowsメタファイルとしてグラフィックをコピーして保存する（MS Windowsのみ） 仮想制限ダイジェスト 事前定義およびユーザー定義のDNAラダーを描く ダブルクリックでバンドをテキストに接続します ABIシーケンストレースファイル ABIトレースのシーケンスは参照シーケンスに直接整列させることができ、アライメントはハイパーリンクされてTEトレースに戻ります。 すべての開いているWindows で、複数の基準（Union / InterSection-Cut Frequency、Site Type）と一致するサイトを選択します。 他の順序でもっと頻繁にカットされたサイトを選択します（SNIP-SNP検出や診断ダイジェストの場合） は、例えば分解するためのユーザー定義の酵素のグループ化をしています。現在在庫がある酵素。 ユーザーが名前と認識サイトで新しい酵素を定義できるようにします REBASEから入手可能なDNAストライダーフォーマットファイル（シンプル酵素、サイトリスト）をインポートする ほとんどの分析ウィンドウは、次のものを含む、対応するシーケンスにハイパーリンクされています。 グラフィックマップ テキストマップ 仮想ダイジェスト アライメント（ABIシーケンスを含む） サイレントサイト 翻訳 プライマーFind はカスタム機能定義ライブラリを使用します。 シーケンスのクイックアノテーション あなたがシーケンスにハイブリダイズしているすべての利用可能なプライマーの迅速な検索と強調表示 注釈を付けて視覚化され、迅速かつ効率的に視覚化されている プライマーバインディングサイトとすべての興味深いシーケンス機能を示すグラフィックマップ 任意のDNAアラインメントとのシーケンスを変換する ユーザー基準に一致する潜在的なプライマー（長さ、TM、％GC、自己/その他の相補性） は、2つのDNAシーケンス（または配列とABIトレースの任意の組み合わせ）を整列させ、アライメントを元のシーケンスにハイリックリンクしたものである 翻訳的にサイレント制限サイトを見つけます グラフィックORFマップを描画する

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