海の眺め

このアプリケーションはさまざまなアライメントフォーマットを読み書きできます。
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海の眺め ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 出版社名:
  • Manolo Gouy
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 1.1 MB

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海の眺め 説明

Seaviewは、配列アラインメントと分子系統発生を支援するための特別に設計されたソフトウェアアプリケーションです。 Nexus、MSF、Clustal、Fasta、Phylip、Mase、Newickファイルなど、さまざまなファイル形式を読み書きするための能力を統合しています。 Portable Packagethisは、Windowsレジストリ設定情報を変更する方法でインストールされずにコンピュータ上で直接実行できるスタンドアロンプログラムです。 USBフラッシュドライブなどの任意のストレージデバイスにユーティリティを保存できます。 ポータブルツールを使用している場合の最良の部分は、ホストコンピュータ上のファイルや設定を残さないようにプログラムを実行するために管理者権限を必要としないことです。 ユーザーインターフェースユーザーGUIはビジュアル部門ではあまり印象的ではありません。実際には実用的で扱いやすいです。ドラッグアンドドロップサポートも機能リストにあり、外部ファイルからデータをすばやくインポートできます。 データを探索するためのキーボードショートカットを利用することも、アイテムを選択し、選択したシーケンスを別の場所に移動するためにマウスクリックを押すことができます。このツールはコマンドラインを使用して実行することもできます。 オプションユーザーのインポート/エクスポートは列挙されているサポートされているファイル形式から列挙されているファイル形式では、EMBL、GenBank、Swissprot / Uniprotなどのさまざまなデータベースから情報を追加できます。 さらに、現在のファイルにアラインメントを保存するか、データをファイルにエクスポートし、配置をPDFファイル形式に保存することができます(フォント、ブロック、用紙サイズを変更し、色の変更、および可変サイトの出力のみを変更する自由が与えられます。アライメントとその位置の。あなたは名前やランクによって別のものの末尾に1つの整列を追加することを許可されています。 編集機能とAlignment OptionSeaviewには、選択したシーケンスをクリップボードにコピーしたり、アラインメントデータをクリップボードの貼り付け、アラインメントからすべてのシーケンスを選択したり、外部のコメントの名前を変更したり、外部を貼り付けることでシーケンスを変更したりする。データまたは2つの編集シーケンスパネルとそれらの間に情報を転送する。 シーケンスに適用できる他の便利なタスクは、それらを削除、作成およびロードすることを参照してください。さらに、それらを複製して逆転させることができ、ドットプロット分析を実行し、アラインメントからすべてのギャップサイトを削除し、選択した配列をタンパク質に翻訳するための遺伝コードを設定します。 整合性を管理するのに役立つアクションに関しては、すべてのまたは選択されたシーケンス、選択されたサイト、またはプロファイル(より具体的には具体的には整合されたシーケンスのグループ)を実行することができます。 構成設定やその他の強力なツールスバーを使用すると、配列を表示するために使用されるフォントサイズを設定し、DNA配列をタンパク質のものとして表示し、タンパク質配列を定義するためのカラー規則を使用し、塩基またはアミノ酸配列組成物の統計、遷移およびトランスバージョン数を指定します。さらなる分析のために記憶される複数のアラインメントの一部は、種をセットし、作成および保存するために、MASEまたはNEXUSフォーマットを使用する場合は、画面下部にコメント行を挿入し、検索を実行します。 さらに、DNAまたはタンパク質系統樹の木、プロット、保存系統の樹木の木を計算、描画、輸入、維持し、そして産卵系の樹木系の木材の分析を行うことができます。 一番下の行 全体として、Seaviewは、複数の配列アラインメントと分子系統発生のための高度なプログラムであり、特に電力ユーザーに適しています。 Ana Marculescuによってレビューされ、最後の更新2014年9月26日に更新されました


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