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狂気の 説明
Musiteは、一般的なものとキナーゼ特異的なプロテインリン酸化部位の両方を予測するためのバイオインフォマティクスツールを提供するように設計された、使いやすいJavaベースのアプリケーションです。 主な特徴： 現在のツールのさまざまな制限事項に適用され、実験的に検証された大きさの大幅なリン酸化部位をよりよく利用するために、特に一般的な一般的な予測のために特別に設計された独自のスタンドアロンアプリケーションシステム・マイサイトを開発しました。およびキナーゼ特異的リン酸化部位 イサイトは、リン酸化部位の局所配列類似パターン（KNNスコア）およびジェネリック特徴（無秩序スコアおよびアミノ酸周波数）を利用し、予測をするための包括的な機械学習アプローチを採用した。 我々は、リン酸化部位が6つの生物における燐光タネミスデータの無秩序領域に優先的に位置していることを前回の発見を確認した。 usiteは、ユーザー自身のデータからリン酸化サイト予測モデルを訓練するためのユーティリティを提供し、ストリンジェンシーレベルの継続的な調整をサポートします。 Musiteはユーザーフレンドリーなグラフィックユーザーインターフェースを提供しています。 6つのプロテオームに及ぼすマイソンの応用は、ストリンジェンシーの高い数万の推定リン酸化部位をもたらした。これらの予測は実験的検証のための有用な仮説を提供します。 交差検証試験は、原音が一般的なリン酸化部位を予測するための既存の道具を有意に有意に凌駕し、そしてキナーゼ特異的リン酸化部位を予測するためのものには少なくとも匹敵することを示している。 また、オープンソースソフトウェアとして、黄色はリン酸化部位予測のための機械学習アプリケーションを構築するためのオープンプラットフォームとしても働くことができます。
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