区間 スケーラブル分子動力学シミュレータ。
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NAMDは、大型生体分子系の高性能シミュレーション用に設計された並列分子動力学コードです。 チャーム++並列オブジェクトに基づいて、Gigabitイーサネットを使用した商品クラスタ上のハイエンド並列プラットフォームおよび数十プロセッサのNAMDは、数百のプロセッサにスケールされます。 NAMDは、シミュレーション設定と軌道分析のために人気のある分子グラフィックスプログラムVMDを使用していますが、オレンジ、Charmm、およびX-Plorとのファイル互換性があります。 それが本当に可能なものを見ようとしてみてください！

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