 | 正規化溶出時間（ネット）予測ユーティリティペプチド配列の予測正規化溶出時間値を計算する |
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正規化溶出時間（ネット）予測ユーティリティ ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- Freeware
- 出版社名:
- Pacific Northwest National Laboratory
- オペレーティングシステム:
- Windows All
- ファイルサイズ:
- 646 KB
正規化溶出時間（ネット）予測ユーティリティ タグ
正規化溶出時間（ネット）予測ユーティリティ 説明
正規化溶出時間（NET）予測ユーティリティは、ペプチド配列のリストについて予測された正規化溶出時間（NET）値を計算するように設計された小さなユーティリティです。溶出時間は、逆相液体クロマトグラフィー（例えば、C 18被覆シリカ粒子を使用した）分析での使用を意図しており、LC - MSおよびLC - MS / MSデータセットの整列（予測された溶出時間を使用して）使用される。各データセットを整列させるためにマスターインシリコデータセットを形成する。予測された溶出時間は、質量とネットの両方を使用して入力ファイル内の一意に識別可能なペプチドの数を計算するときに、タンパク質消化シミュレータ基本によっても使用されます。 正味予測ユーティリティは、各系統上の1つのペプチド配列を含むテキストファイルからペプチドを読み取る。出力ファイルは、1つまたはすべての予測アルゴリズムを使用して、ペプチドシーケンスと予測された正味値（および/または予測SCX値）を含みます。 ・カンガー/巣炎LC保持時間モデル ・カンガス/根茎SCXフラクションモデル ・クロッキン疎水性モデル ・マント疎水性モデル
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