 | 生産するタンパク質構造ダイナミクス分析用のオープンソースPythonパッケージ |
| 今すぐダウンロード | |
生産する ランキングとまとめ
広告
生産する タグ
生産する 説明
タンパク質構造ダイナミクスを分析するためのオープンソースPythonパッケージ Prodyは、タンパク質構造ダイナミクスを分析するためのフリーおよびオープンソースのPythonパッケージです。それは不均一な実験的構造データセットの定量分析と理論的に予測された立体配座動力学との比較を可能にします。ピッツバーグ大学でBahar LabのAhmet Bakanが設計＆開発しました。 PRODYの入力は、PDBファイル形式、単にPDB IDまたはタンパク質の単一文字アミノ酸配列におけるクエリタンパク質の原子座標である。高速で柔軟なPROSYパーサーは、PDB FTPサーバーからPDBファイルの対応するデータセットを取得し、それらの座標データおよびその他の関連情報を抽出するために使用されます。 PRODY実験データセットの主成分分析（PCA）によって抽出された構造的変動、および弾性モード分析（ENMS）に基づく通常モード分析（NMA）によって予測されるタンパク質の固有動力学を記述する通常のモードを出力します。
生産する 関連ソフトウェア
