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針葉樹 ランキングとまとめ
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針葉樹 説明
議論者は、エクソーム読み取りからのコピー数の推論としても知っています。読み取りのコピー数の亜種（CNV）を探すためにEXOMEシーケンスデータを使用し、複製された遺伝子のコピー数を検索するPythonベースのツールです。 エクソーム捕捉反応がサンプルバッチ間の強力で系統的な捕捉バイアスの対象となるにつれて、私たちは特異値分解（SVD）を実行して、エキソームデータでこれらのバイアスを除去しました。 針葉樹は、バッチバイアスを排除することによって、複数の実験的実行からのエキソームシーケンスを混合する能力を提供します。 複数の場所への読み取りを整列させる可能性があるMRSFASTなどの短い読み取りアライナと一緒に、針葉樹はまれなCNVを堅牢に検出し、現在のエクソームキャプチャキットを使用して最大8コピーの複製遺伝子のコピー数を推定することができます。
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