二枚貝

このツールを使用してシーケンスを分類します。
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二枚貝 ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • The Regents of the University of California
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 20.4 MB

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二枚貝 説明

Clamsは、メタゲノミックシーケンスのシーケンス構図ベースの分類器を提供するように特別に設計された便利なアプリケーションです。 アサリは、配列組成に基づいて各シーケンスのシグネチャをキャプチャすることによって機能します。 各シーケンスは、基礎となるマルコフチェーンプロパティを備えたDE BRUIJNグラフの散歩としてモデル化されています。 Clamsは、基礎となるマルコフチェーンの静止パラメータと、基礎となるDE BRUIJNグラフの構造パラメータを取り込み、この署名を形成します。 実際には、各シーケンスのビン化のために、そのようなシグネチャは計算され、トレーニングセットに対して計算された類似の署名と一致する。 正規化された距離カットオフの勝利も適格な最良の一致。 最良の一致がこのカットオフを修飾していない場合、シーケンスは非ビンニングのままです。


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