 | ANC遺伝子距離ベイジアン法による祖先遺伝子配列の推論 |
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ANC遺伝子 ランキングとまとめ
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ANC遺伝子 説明
ANC遺伝子適用は、系統発生関係が知られている現在の日配列のセットからのタンパク質コード遺伝子の祖先ヌクレオチド配列を推定するための小さな指揮系統ツールであるように開発された。 このプログラムは、最初にアミノ酸を距離ベースのベイジアン法により浸透させ、次いで推定アミノ酸を固定することによって下にあるヌクレオチド配列を浸透させる。 プログラムを使用するには、DNAシーケンスとこれらのシーケンスのツリートポロジーを含む入力ファイルが必要です（例ではRNASE.SEQを参照）。このファイルは、シーケンス数とシーケンスごとのヌクレオチド数（シーケンス長）から始まります。 2行目は最初のシーケンスの名前になり、3行目は最初のシーケンスになります。配列中には、A、T、C、G、A、T、C、Gのみが許容される。シーケンスは整列され、ギャップまたは他の任意のシンボルを削除する必要があります。ファイルの最後の行はシーケンスのツリートポロジです。ツリー形式はPhylip Package（FelsenStein 1995）で使用されているものと同じです。ツリーは未承認されていないため、深い分岐ノードには、バイ化ではなくトリケートが必要です。
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