BioImageXD これは多次元生物医学的画像の分析と可視化のための無料のオープンソースソフトウェアです。
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BioImageXD 説明

BioImageXDは、多次元画像データを処理、分析、および視覚化するためのソフトウェアパッケージです。その名称が意味するにつれて、ソフトウェアは主に生物学的データ、例えば生細胞の共焦点顕微鏡画像を対象としていますが、あらゆる種類の多次元画像データを処理するのに十分適しています。 BioImageXDは、単一の大きなウィンドウに基づく単純で直感的なユーザーインターフェースを持ち、その操作は一貫性と機能的になるように設計されています。 BioImageXDは、高度なファイル入出力機能と複数の視覚化モード（単純な2Dスライスビューから高度な3Dレンダリングまでの範囲）を提供します。これらは、任意の多数のタスクモード（チャネルマージ、共同解析、強度補正、およびノイズ、セグメンテーション、トラッキング、測定などを除去するためのさまざまなフィルタを含む）のいずれかと自由に組み合わせることができます。 組み込まれたAnimaterを使用すると、カメラパスの時点の変更や角度を閲覧することが完全に制御されているため、見事な動きを作成できます。 主な特徴： 画像表示： 一般的な顕微鏡フォーマット（または画像や画像のスタック、時系列）でデータを開き、データ画像を画像で表示します。 画像処理： 色/明るさ/コントラスト/ガンマを調整し、データセット/チャンネルの色またはパレットを変更し、ノイズを除去し、時系列データで蛍光漂白を補正してください。 3Dボリュームレンダリング： 3Dデータセットは対話的にレンダリングされることができます 映画作り： Animatorモジュールを使用して、3Dデータの周囲にカメラのパスを設定し、その映画を回転させて飛ぶことをしてください。時系列データがサポートされています。 "4Dデータ"。 共局在分析： 私たちはあなたのすべてのあなたのすべての細胞生物学者が共同顕微鏡を使用して共同局在を探しています！私たちの共同局在ツールを使用すると、マルチチャネル3Dデータセット内の信号強度の共局在を分析し、Zスタック投影画像で見られる偽の共局在の問題を回避し、その量と品質についての統計的分析を実行する統計分析を実行することができます。あなたのデータの共同局在コストet et al。 AFM画像の表示： 原子間力顕微鏡および関連イメージング技術は、3Dサーフェスとしてレンダリングできる画像を作ります。いくつかの便利な画像フィルタなどを追加することもできます。ある種のAFM形状 - PDBまたはCryoem構造/モデルフィッティングツールをいくつか持っているかもしれません。 CONOCAL 3Dデータセットを使用したセル表面高さ画像のコマプリシン マルチプロセッサ、並列計算、クラスタ、スーパーコンピュータ： FinHPCプロジェクトの一部として、BioImageXDがイメージ処理やその他の機能を並行して実行することを計画し、デスクトップ上のCPU特定のベクトル化コード（G4とG5のAltivec / Velocity Engine、およびMMX SSE SSE2 SSE3）を使用できるようにする予定です。大規模な共有メモリを持つコンピュータ、クラスタ、ワークステーション、サーバー、およびスーパーコンピュータ

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