DNADISTREEの DNA配列からの距離に基づく系統発生推定のためのソフトウェア。
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DNADISTREEの 説明

DNADISTEREは、種間で正確なトポロジー関係を表示する距離に基づく系統的な木を推測するように設計されています。 より正確には、dnadiStreeはいくつかの連続するステップを実行します。 それはDNA配列アラインメント（ヌクレオチドまたはコドン）を読み取る。 2.各シーケンスのペア間の不偏ペアワイズ距離を推定します。 その目的のために、DNADISTEREはしばしばDNAまたはコドンモデルの両方の進化モデルに基づいて数多くの式を使用しています（詳細はこちらを参照）。 3. 4つの凝集アルゴリズムのおかげで系統発生木を作ります。 それは距離行列および/または距離ベースの木に関連する統計的尺度を計算する。 それにもかかわらず、dnadiStreeは堅牢な分岐長を推定するようには設計されていません。 より正確な距離またはMLベースの分岐長の推定値のために、DNADISTEREによって推論される木とのFITCH（Phylipパッケージ）、FastME、Phyml、またはPamlを使用することをお勧めします。 それが本当に可能なものを見ようとしてください！

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