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Dotplot 説明

急速な満足のために、ファイル名A2およびA3の下に保存されたSwissprotからの2つのニューロンニコチン性アセチルコリン受容体サブユニット配列を比較してみてください。インターフェースは他のWindowsプログラムのようなものです。 メニューを使用して水平シーケンスをロードします。 現在のディレクトリ内のすべてのファイルをリストしたダイアログボックスを表示します。 A2を選択してから、プログラムはSEQINFOダイアログボックスを提供します。これは、IEをロードしたばかりのシーケンスについて少しわかります。その名前、長さ、配列フォーマット、およびそれがDNA、RNAまたはタンパク質かどうか。 をクリックします。次に垂直シーケンスを繰り返し、A3を選択します。 MSDOSバージョンと同様に、以下に詳細に説明されているDotPlotを計算する方法は2つあります。クイック修正の場合は、描画ポップアップメニューのIDを使用します。デフォルトのパラメータは、ウィンドウサイズ10、しきい値6のしきい値です。これにより、画面に対角線があります。パラメータをクリックして、しきい値を1に設定してDotplotを微調整してみてください。タンパク質の真ん中に3つの膜貫通領域とC末端の最終膜貫通を見ることができます。 ヒト上皮成長因子受容体において内部の反復を見つけようとします。これを行うには、EGFRと呼ばれるシーケンスを水平シーケンスと垂直シーケンスの両方としてロードします。次に、パラメータをウィンドウ= 20としきい値= 1として設定します。ファイルポップアップメニュー「オープンマトリックス」オプションを使用してPAM250.MATスコアマトリックスをロードします。 Dotplotアプリケーションはドットプロット分析ツールであるために開発されました。

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