FASTML. 系統発生木の祖先アミノ酸配列を計算するためのプログラム
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FASTML. 説明

FASTMLは、系統樹の先祖アミノ酸配列を計算するためのプログラムであるために開発されました。 使用法： FASTMLはコマンドライン引数でフラグを使用します。 - ヘルプの場合、 "fastml.exe -h"と入力してください -s seq.aln =シーケンス入力ファイル名。 -t tree.txt =入力ツリーファイル名（ニュミック形式）。 プログラムは、Phylip、Molphy、Fasta、MASE、Clustal、またはNexusのいずれかの配列フォーマットのいずれかを自動的に認識します。 モデルを選択するには、-mオプションを使用します。 以下のモデルがサポートされています（アミノ酸の場合）：Day、JTT、Rev、CPrev、WAG、JC。 ヌクレオチドの場合、現在JCモデルのみがサポートされています。 デフォルトのモデルはJTTです。

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