GAファジィクラスタリング マイクロアレイデータのクラスタリングツール
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GAファジィクラスタリング 説明

GAファジィクラスタリングアプリケーションは、マイクロアレイデータと距離行列データのクラスタリングのための遺伝的アルゴリズムとC平均法の組み合わせを使用するプログラムであるように開発されました。 入力ファイル形式:: - このプログラムは入力としてプレーンテキストファイルを使用します。 - すべてのデータ項目はタブレータで区切る必要があります。 - 欠損値は許可されていません。 マイクロアレイ： - 最初の行にすべての列の名前が含まれています。 - 各行（2秒から始まる）は、遺伝子名（1列以上）と各条件についての発現値を持っている必要があります。 距離行列： - 最初の行にはキャプション（1つの位置の単語または文字列）が含まれています 要素の名前 - 各行（2番目から始まる）には、要素の名前（対応する列と同じ）とこの要素と他の要素の間の距離の値が含まれている必要があります。 - 行列は対称です。 - すべての値は正規化されています（1.0以下）。 - 注：類似マトリックスも許可されています。 出力ファイル形式： - アルゴリズムのパラメータ - クラスタ内の遺伝子の分布（会員が> 1 / NuberofClustersの場合） - すべての遺伝子のメンバーシップマトリックス - クラスターの中心の座標（遺伝子発現単位）

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