 | MDL.分子動力学言語 |
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MDL. ランキングとまとめ
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MDL. 説明
ユーザーが高レベルで分子動力学（MD）シミュレーションを表現できるようにします 分子動力学言語（MDL）は、ユーザーが高レベルで分子動力学（MD）シミュレーションを表すことを可能にすることを目的としています。これには、オブジェクトとベロシティセットの両方を含む、いくつかの異なる方法を使用して、実行されているシミュレーションとプロトタイプの新しい統合方式と直接対話する機能が含まれます。言語はPythonに基づいて構築され、一部開発されたソフトウェアフレームワークProtomolから一連のスモグラップライブラリを使用し、長距離の力計算の重大なパフォーマンス要件を満たしています。新しい力評価アルゴリズムの追加とテストは、MDLのモジュール設計、および新しいシミュレーションプロトコルを通じて役立ちます。 APIには、シミュレーションデータ、入力および出力データ、データとフォーマットのデータと出力データにアクセスする機能が含まれています。データプロットの追加、さまざまな種類の力を個々のインテグレータに追加し、PythonのProtomolフレームワークから既存のインテグレータを使用し、データベクトルを高速数値配列に変換します。 。
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