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 | MapMaker.遺伝的連鎖分析プログラム |
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MapMaker. ランキングとまとめ
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MapMaker. タグ
MapMaker. 説明
MapMakerは、遺伝的連鎖マップを構築し、遺伝子マッピングを実行するために使用できる一連のアプリケーションです。 軽量パッケージ内で配信されている、それは2つのコマンドラインツール、つまりMapMaker / ExpとMapMaker / QTLをバンドルします。最初のものには、一次連携グループを生成し、出力を分析して支配的な共同マーカー、および劣性マーカーを決定するためのオプションが付属していますが、後者は以前に生成されたリンケージマップを使用して遺伝子をマッピングできます。 MapMaker / Expは、さまざまな種類の交差点（バッククロス、インターロス、TestCross、Hoploidデータ）から派生したデータセットを含むフラットASCIIテキストファイルで動作します。他のアプリケーションは、F2交換データとバッククロスデータでのみ機能します。 分析用にデータ・セットを準備してMapMaker / Expにロードすることから始めます。アプリケーションには、遺伝的シーケンスのリスト、編集、名前、または消去に使用できる幅広いコマンドが付属しています。シーケンス内のマーカーを挿入します。 マーカーのペアに対してペアワイズ分析を実行し、マルチポイント解析を実行できます。それは染色体にマーカーを割り当て、いくつかの遺伝子座のマッピング状況を表示することができます。 プログラムはジェノタイピングエラー検出機能を特徴とし、HAplotypesを単一のデータセットにまとめることを可能にします。データをデータベースに保存し、ステータスとマッピング結果をコンピュータに保存することができます。 MapMaker / QTLは、さまざまなTRATコマンドを特徴とし、取得したデータをPostScriptで保存することを可能にし、QTLマップなどを比較することを可能にします。
MapMaker. 関連ソフトウェア
