Pppbenchmark. 最先端の最先端のプロモーター予測プログラムの大規模ベンチマーク研究
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Pppbenchmark. 説明

プロモーター予測評価のための金標準として使用することができる多面的な評価戦略が提案され、プロモーター予測ソフトウェアの著者がそれらの方法を適切な方法で既存の方法に比較することを可能にする。 この評価戦略は、その後、選択されたプロモーター予測器を比較するために使用され、予測性能、プロモータークラス特異性、予測の位置バイアスおよび予測の位置バイアスに関する重複分析が行われる。 このプログラムを使用して新しく開発されたプログラムを検証するときは、PPPBenchmarkの検証に使用されているデータをプログラムのトレーニングデータとして使用しないことが重要です。 ここで適切な手順は、データをトレーニングとテストに分割し、各分割のプログラムとPPPベンチマークを実行することです。データを分割する最善の方法は、完全な染色体のレベルにあります。例えば、トレーニングのために23の染色体を使用し、検証のために除外されています。残っている各染色体についてこれを行います。 Pppbenchmarkを入手して、実際にあなたのためになることができる方法だけを見るための試みを与えます！

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