SAVIシグナリング分析と可視化

細胞成分と細胞成分からなるネットワークを分析して可視化します。
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SAVIシグナリング分析と可視化 ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Free
  • 出版社名:
  • Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan
  • 出版社のWebサイト:
  • http://www.mssm.edu/labs/maayan
  • オペレーティングシステム:
  • Windows Me, Windows 98, Windows 95, Windows 2000, Windows NT, Windows XP
  • ファイルサイズ:
  • 20.35MB

SAVIシグナリング分析と可視化 タグ


SAVIシグナリング分析と可視化 説明

生体分子がノードとして表され、それらの相互作用はリンクとして表されるグラフ(ネットワーク)としてのタンパク質 - タンパク質およびリガンド - タンパク質相互作用を見る。 。大規模なシグナリングネットワークの出現は、そのようなネットワークの視覚化を表す一方で、トポロジー統計分析の機会を提供します。 SAVIは、ネットワークモチーフの視覚化と同様に、クラスタリング、接続性の分布、検出、および視覚化を計算するための標準的な方法を実装しています。さらに、SAVIはテキスト形式のネットワークデータセットから完全なWebサイトを生成します。 SAVIにはPathwayGeneratorというツールが含まれています。このツールは、セルシグナリングのインタラクションを記述する大きなテーブルからのWebページとして接続マップを作成します。 SAVIはまた、遺伝子/タンパク質名のリストからネットワークを作成することができます。 バージョン2.5には、不特定のアップデート、機能強化、またはバグ修正が含まれます。


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