TFSearch Viewer. ランキングとまとめ
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TFSearch Viewer. 説明
シス - 調節要素は、同様の発現パターンを示す一組の遺伝子の上流配列において濃縮することができ、これは、Syn発現遺伝子の上流配列中の転写因子結合部位(TFBS)を検索することによって行うことができる。 TFSearch Viewerは、TFSearch Serverに複数のシーケンスを自動的に送信するように設計された便利なJavaベースのツールで、その後、すべてのシーケンスの検索結果の中で共通のTFBSを検索し、転写レベルでの転写因子を介して遺伝子セットの共調整の証拠を提供します。 。 結果ファイルは各配列で識別された各TFBのカウントを示す、TFBSは提出された全ての配列間のそれらの発生によってランク付けされ、したがってTFBについて100%の潜在的なものは結合部位が全ての配列において検出され得ることを意味する。
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