WPDBデータベースローダー 高速かつ容易な生物学的高分子の3D構造を分析する。
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WPDBデータベースローダー 説明

WPDBデータベースローダーは、上記のようなクエリと表示ツールを使用して、タンパク質データバンク（PDB）に見られるように、プロテインデータバンク（PDB）に見られるように、生物学的高分子の3次元構造を調べるのに役立つ便利な、使いやすいツールです。 主な特徴： 科学： テキストとシーケンスの検索（許可されたミスマッチ）に基づく構造を見つけます。 1つのレジスタシーケンスの1つのレジスタシーケンスと針マンとWunschの方法に従って、（JMB 48（3）：443-453,1970）。 Hendricksonの方法に従ってCalpha位置を用いた構造重ね合わせ（Acta Crysta35：158-163,1979。 カブシュとサンダーの方法に従って二次構造の割り当て。 アミノ酸特性プロファイルプロファイル分析、静的および動的の両方：Bogardtらによって編成された値に従って静的。 2つのポリペプチド鎖または2つの整合ポリペプチド鎖についての単一のポリペプチド鎖または差プロファイルのためのLEEおよびRichardsによる動的、平均露出および実験B因子プロフィールを調べることができる。 コンタクトマップ解析異なるカットオフ距離で、構造体または重ね合わせ構造（差分コンタクトマップ）の異なる原子群を調べることができます。 典型的な3次元の表示とレンダリング、下部構造、CPK表現、ステレオ、および単純な表面（ユーザーからの距離に基づく色）を含むオプションを含めます。 グラフィック表現や小分子距離からの偏差を含む、幾何学的計算（結合長、結合角度、二面角、近接非接合コンタクト）。 コンピューティング： データ圧縮 - PDB ASCIIファイルの配布に対するストレージの約20倍の減少ですが、（i）著者とJRNLレコードに限定されています。 （ii）任意選択で、NMRまたはモデル構造のアンサンブルの最初のまたはすべてのメンバー。 （iii）部分的な占有構造を有する結晶構造の部品についてPDBファイルに定義されている第1の代替立体配座のみ。 （iv）2つの小数点以下の桁数に丸められた原子座標。 （v）PDB備考記録なし。 相互運用可能な表示オブジェクト - 1つの表示オブジェクト（E.GAコンタクトマップ）で機能が選択されている場合、他のすべての表示オブジェクト（E.G3-Dビューア）とその後呼び出されるものもその機能を説明するために更新されます。 。 ラスウェインへの直接アクセス一般的な分子ディスプレイプログラム。 印刷されたドキュメントと文脈依存のヘルプを作成しました。

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