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adm adm 説明
Admixは、見積もり者を数ステップで計算するのに役立つように設計された、小型でシンプルで使いやすいアプリケーションです。 入力ファイルは次のとおりです。 ・1行目:Ammixtureイベントまでの時間帯(この時間がわからない場合は、代わりに0を書く必要があります。) ・2行目:年間の突然変異率(前行にある時間が与えられた場合、突然変異率を示す必要があります!) ・3回目:親の人口の数 ・4行目:遺伝子数の数 ・後の行:各遺伝子座について: ・1行目:遺伝子座の名前(この行には少なくとも1文字が含まれている必要があります) ・2行目:その遺伝子座で観察された異なる対立遺伝子(k)の数 ・次のK線:対立遺伝子間の分子距離を指定する下三角行列。 DNA配列またはRFLPSの場合、2対立遺伝子間の分子距離は単なる置換数である。マイクロサテライトデータの場合、分子距離は対立遺伝子サイズの二乗差分である(詳細についてはBertorelleおよびExcoffierを参照)。 ・後の行:各遺伝子座について: ・1行目:遺伝子座の名前(この行には少なくとも1文字が含まれている必要があります) ・2回目:混合したサンプルサイズ(染色体数)、およびその遺伝子座の親の個体集団。最初の数字は混合集団を指します。以下の数字は親の個体群を指します。 ・次のK線:各母集団について、各母集団について、各対立遺伝子のコピー数。繰り返しになると、最初の数字は混合された集団を指し、そして以下の数は親の集団を指す。
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