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亜硫酸塩 - 配列/ NOME - 配列SNPおよびシトシンメチル化発信者
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  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • USC Epigenome Center
  • ファイルサイズ:
  • 8.1 MB

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b b 説明

Bissnpは、ゲノム分析ツールキットに基づく有用なツールとして特別に開発されました。 BissNPは、遺伝子型およびメチル化レベルを同時に決定するための異なるシトシン状の異なるシトシン状のメチル化確率のいずれかを用いてベイジアン推論を利用する。 ソフトウェアはシングルエンドおよびペアリングの読み取りのために機能することができます。 BissnpはJavaプログラミング言語で開発されています。 主な特徴: COLCENT(CpG、CHH、CHG、GCH et.al。); 正確な変種検出。 亜硫酸塩シークエンシングでの基本品質の再校正とインデレル照会を有効にします。 複数の出力フォーマット、詳細なVCFファイル、CPGハプロタイプがモノラル化メチル化分析のためのファイルを読み取る。 UCSCゲノムブラウザおよびIGVブラウザでの可視化のための簡体字ベッドグラフ、WIGおよびベッドフォーマット。


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