bl bl はヌクレオチド配列を整列させるであろう
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BlastAlignアプリケーションは、NCBI BLASTを使用して、大きなインデルス（挿入/欠失）を持つヌクレオチド配列を調整するか、そうでなければグローバルに整列するのが困難です。 プログラムは、入力シーケンスから最も代表的なシーケンスを選択してから、BLASTクエリを抽出し、複数のアライメント（NexusおよびPhyxusフォーマット）を抽出します。 あるいは、ユーザは、どのシーケンスをアンカーとして使用するかを選択することができる。 プログラムはまた、順序に沿って相同性の領域を表す行列を出力する。これは、特定の大きなインデルを共有するサブグループを視覚的に識別するために使用することができる。 追加のプログラム、BLASTALIGNPはTBLASTNを使用してヌクレオチド配列を単一のアミノ酸基準配列に整列させ、オープンリーディングフレームを複数のアライメントに維持することができる。

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