cbcanalyzer 代償塩基変化（CBC）に基づく系統発生
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cbcanalyzer 説明

CBCanalyzer（CBC =補償ベース変更）は、3つの部分、CTTransform、CBCDETECT、およびCBCTEREからなるカスタム書き込みソフトウェアツールボックスであるように開発されました。 CTTransformは、いくつかのCTファイルフォーマット（CT、RNAVIZ CTまたはMAC CT）を読み取り、通常、RNAperter、RMOVIEまたはMARNAなどの他のツールの入力として使用される、いわゆる「ブラケット - ドットブラケット」フォーマットを生成します。 後者は、次のプライマリシーケンスとCBCDETECTの入力として使用できる二次構造に基づいて複数のアライメントを作成します。 これにより、整列されたシーケンスの全てにCBCがカウントされており、これらは種を検出するのに重要であり、性的な不適合性に区別されています。 CBCDETECTによって得られたカウント（距離）行列は、Bionj.Noteのアルゴリズムを使用して球形を再構築するCBCTREEの入力として使用されます.CBCanalyzerは非業務用途に自由に利用可能です。

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