dtscore. ランキングとまとめ
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dtscore. 説明
DTSCOREアプリケーションは、距離に基づくタンデム複製ツリー再構成アルゴリズムであるように開発されました。 それは単純なタンデム複製モデルに基づいています。 入力として取るのは、コピー間の距離行列です。 この行列では、コピーが軌跡上に並べられているのと同じ方法で行と列を注文する必要があります。 DTScoreは比較的大きなデータセット(100コピー以上)に適用できます。 距離は、Phylip PackageからのDNADIST(ヌクレオチド配列)またはプロトディスト(タンパク質配列)などのプログラムを用いて計算することができる。 部位間の不均一置換率は、例えばガンマ法を用いて対処することができる。
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