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jcompoundmapper 説明
化学グラフ用の人気のある指紋アルゴリズムを提供するために、JCompoundMapperが作成されました。このグラフの中には、深さの最初の検索フィンガープリント、最短の指紋、拡張接続指紋、自己相関フィンガープリント（例えばCATS2D）、ラジアルフィンガープリント（例えば、Molprint2D）、幾何学的なモリント、原子対、およびファーマコフトフィンガープリントがあります。 JCompoundMapperは、libsvm、liblinear、およびwekaなどの機械学習ツールのためのいくつかのフォーマットの輸出業者を提供しています。 アプリケーションは、検索深さ、距離カットオフ、または原子タイピングなどのパラメータ化を可能にします。ハッシュした指紋の場合は、ハッシュ空間のサイズを設定できます。 クラスタリングアプローチのための類似性行列の計算のためのJCompoundMapperまたはlibsvmの入力フォーマットとして ソフトウェアは、軽量のJARライブラリまたはスタンドアロンの実行可能ファイルとして使用できます。 JCompoundMapperは、リベラルライセンスを備えたオープンソースソフトウェアにのみ基づいています。化学開発キットの化学専門家システムを使用しています。 プログラムの主な目標は以下のことです。 ・データマイニング実験のための標準的な指紋実装を提供します ・正確な定義を持つオープンソースの実装 ・記載されているタスクの使いやすいコマンドラインツール ・例えば、同じラベリングアルゴリズムを有するアルゴリズムを比較することができる新しい指紋符号化の開発のための基礎を提供する。
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