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jmotifinder. 説明
JMotiffinderは、巨大なEMBLファイルのプライマーなどのDNAモチーフを見つけるためのグラフィカルなユーティリティをユーザーに提供するように設計された小型で簡単で使いやすいアプリケーションです。 EXONおよびMRNA情報を含むEMBLファイルをJMotiFinderにロードすると、ソースシーケンス内のエクソンとmRNAの位置をグラフィカルに表示します。 検索ボタンを介してMotifを検索することができ、JMotifinderはソースシーケンスでもMRNAシーケンスで検索できます。 このアプリケーションはまた、リバースストランドに適合するプライマーを見つけたい場合は、逆モチーフのために自動的に検索されます。 シーケンスのグラフィカルな視覚化に加えて、JMotiffinderはあなたが探していたモチーフの木構造を構築し、基礎となるソースシーケンス内の場所とmRNAシーケンス内の場所を表示します。 mRNAを印刷すると、MOTIFの位置がmRNA配列で下線を引いています。
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