jpredictor.

はシス調節要素の予測のために最適化されました
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • BiBiServ
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 297 KB

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jpredictor. 説明

JPRedictorプログラムは、シス調整要素の予測のために最適化されました。 短い配列フラグメント、すなわち転写因子結合部位は、そのような元素において濃縮されクラスタ化されることが知られている。 これらの結合部位はモチーフとして表され、予測のためにそれらは知られなければならない。 これらのモチーフを使用して、それらをシーケンスで検索し、それらを正またはネガティブトレーニングセット(それぞれモデルまたは背景)を適用し、シーケンスを獲得することが可能です。


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