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表現型セットの歴史を研究する
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 出版社名:
  • Siddhartha Jonnalagadda
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 3.5 MB

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n n 説明

NEMOは、柔軟な(メタ)個体群の枠組みにおける生命歴/表現型特徴と人口遺伝学の進化を研究するために特別に建てられた、前進、遺伝的に明白で、個々のベースで、確率的シミュレーションソフトウェアです。 NEMOは、さまざまな遺伝建築とのさまざまなライフサイクルイベントと進化可能な形質を実装しています。 寄生虫とその宿主との種の相互作用もモデル化することができる(すなわち、細胞質不適合性誘導エンドシンビ誘発:ウォルバチア)。 これらすべては、パッチ固有の搬送容量、分散速度、確率的な絶滅/収穫率、および人口統計的確率を可能にする柔軟なメタポー組モデル内で囲まれています。 個体群はシミュレーション中に動的に修正することができ、人口のボトルネック、パッチ融合/フィソン、人口拡大などを可能にします。定量的形質に関する空間的に不均一な選択もモデル化することができます。 主な特徴: 形質: 中性マーカー(マイクロサテライト、SNP) 有害な突然変異(軌跡特有の固定またはランダムな効果を持つ、そして優位性) 定量的形質(v2.2.0の新機能)(多面的定量的遺伝子座) 分散(男性および女性特異的表現) ウォルバチア(妊娠中の細胞質非相性性誘導誘導誘導性) ライフサイクルイベント: 育種(乱交、Polygyny、Monogamy、自主管理、クローニング嵌合システム) 分散(移民プール/宣伝プールアイランドモデル、1Dおよび2D格子モデルなど) エージング(天井パッチ規制付き) 生存率の選択(有害な突然変異に基づく、または定量的形質の安定化の選択) 絶滅/収穫 パッチフュージョン/フィッション 交差設計(フルシブ/ハーフシブデザイン)


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