prot prot タンパク質進化の最良適合モデルの選択
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prot prot 説明

Prottest（ModelTestの相対）は、特定のシーケンスセット（アラインメント）に最も適したタンパク質の進化のモデルを選択するためのプログラムです。 モデルが含まれているモデルは、アミノ酸置換の相対的なレートを示す経験的な置換行列（WAG、LG、MTREV、DayHoff、DCMUT、JTT、VT、BLosum62、CPREV、RTREV、MTMAM、MTART、HIVB、およびHIVW）です。 （+ I：不変サイト、+ G：サイト間の不均一性、+ F：観察したアミノ酸周波数）は、タンパク質構造および機能の保存によって不良の拘束を説明するために。 Prottestは、Akaike Information Criterion（AIC）やその他の統計（AICCとBIC）を使用して、どの候補モデルのどちらがデータに最も適しているかを見つけます。 プロテクトAの能力を完全に評価しよう！

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