sat 座りに基づくヘテロ接合重倍数体における非発散SNPデータからのハプロタイプ推論
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sat 説明

Satlotyperは、倍数体とジプロプラススパス型SNPデータからハプロタイプを推定するように設計されたソフトウェアツールです。 Satlotyperはブール演算子と変数を使用して、ブール充足可能性の問題（SAT）のための純粋なパーシモニー（HIPP）によるハプロタイプ推論を定式化します。 HAPLOTYPEを説明する最も派生性の高いセットを見つけるために、SATLOTYPERはハプロタイプを説明すると仮定して始まり、満足のあるセットが見つかるまでハプロタイプの数を増やします。 SATはNP完成であるため、特定のデータに対して解決策が妥当な時間に見られることが保証できません。 しかしながら、経験的なテストは、現実の世界からのデータの推論を計算することが可能であることを示した。 さらに、SATLOTYPERは別の解決策を説明するための制約を与え、ブートストラップ手順によって結果の可能性を最適化することができます。 Satlotyper Aを与えてください。

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