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タンパク質、DNAおよびRNA配列のベイズ分析用ソフトウェア
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • ?dm Novk, Istvn Mikls, Rune Lyngsoe, Jotun Hein
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 4.8 MB

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stat stat 説明

Statalignは、DNA分析を実行できるように設計された高度なオープンソースアプリケーションです。 複数のアラインメント、系統の木々および進化的パラメータは、マルコフチェーンモンテカルロフレームワークで共同推定され、結果の正確さの信頼性の高い測定を可能にします。 このアプローチは、伝統的な方法が計算時間の増加のコストで苦しむ一般的なアーティファクトを排除する。 これらのアーチファクトは、構築された系統発生物質の単一(おそらく小数点)アラインメントおよび整列が依存するガイドツリーへのバイアスに対する偏りを含む。 分析の背後にあるモデルは、進化的に離れた配列の比較を可能にする:TKF92挿入欠失モデルは任意の置換モデルに結合することができる。 ヌクレオチドおよびアミノ酸データのための広範囲のモデルがパッケージに含まれ、プラグイン管理システムは新しいモデルを簡単に追加できるようにすることができる。


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