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タンパクスショップ 説明
タンパク質ショップはタンパク質構造を操作するための対話型ツールです。 タンパク質ショップはタンパク質構造を操作するための対話型ツールです。それは、人間の知識と直感を使ってタンパク質構成のセットを迅速に作成するように設計されました。これらの構成は、ローカルまたはグローバル最適化を受けることができます。 ProteinShopはグローバル最適化プロセス自体を実行していませんが、リモートマシンで実行されている可能性があるグローバル最適化プロセスと対話するために使用できるフレームワークを提供します.ProteinShopの3つのレベルの機能性Ivel I：3Dタンパク質構造を表示・作成アミノ酸配列および二次構造の予測からの1つのアミノ酸、すなわち1アミノ酸、すなわち1アミノ酸。・PDBファイルから3Dタンパク質構造をロードする。・原子球、ボンドスティックなどの標準的な可視化技術を提供する漫画レンダリング。ねじれ、カール、およびプリーツを可能にすることによって・並列/逆並列ベータシートを自動的に形成する。・他の構成で再利用するためのタンパク質の断片を保存/荷重する■セカンダリ構造を整列させるのに役立ちます。構造の予測。・外部から提供されたエネルギー計算コードを使用して3Dタンパク質構造のエネルギーを評価します。・計算されたEnergy.Level III：モニタ/ステアa（リモート）グローバル最適化プロセス・グローバル最適化プロセスから/切断する。・ダウンロード最適化プロセスからの候補構成。・最適化プロセスへの操作構成をアップロードします。・設定のツリー全体をダウンロードすることで最適化プロセスを監視します。インターネット経由でアクセス可能な予測サーバーから入手可能。・e eタンパク質構造の対話型操作の間に生化学的知識と直感を適用するための科学者たちは、代替構造の比較と分析を容易にするために計算された自由エネルギーの視覚化を提供します。・局所的な最適化を適用することにより、低エネルギー構成の発見を促進します。ユーザー選択されたタンパク質構造。・ベータシートトポロジの確率とマッチングalignments.requirementsの確率に基づくさまざまなベータ設定を作成します。 "SRC 'ディレクトリにSRC Directory.GOに含まれており、プロテインショップを構築するための' make 'と入力します。 *** MakeFiletheコンパイラのFLTK設定は、$（FLTK_BASE）/ $（INCDIR）、$（FLTK_BASE）/ $（libdir）、および（FLTK_BASE）/ $（BINDIR）の下の必要なビルドツールを除くファイルを含めます。別のセットアップがある場合は、以下のコンパイラフラグを手に編集する必要があります.fltk_base = / usr / localonいくつかのインストール、fltk OpenGL関数は、separateLibrary、libfltk_glにあります。リンカがUndefinedSymbolsをコンサルにした場合は、-lfltk.fltk_libs = -l $（fltk_base）/ $（libdir）-lfltk_gl -lfltkの前に下の行に-lfltk_glを追加してみてください。
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