 | セグマ脳のMR画像のセグメンテーションのためのSEGMプログラム。 |
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セグマ ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- GPL
- 価格:
- FREE
- 出版社名:
- Paul Hughett
- 出版社のWebサイト:
- http://www.med.upenn.edu/bbl/downloads/other/
セグマ タグ
セグマ 説明
脳のMR画像のセグメンテーションのためのSEGMプログラム。 脳のMR画像のセグメンテーションのためのSEGMプログラムPennsylvania大学の脳行動研究室で開発され使用された画像解析ツールのセットです。それは、脳の行動実験室で使用される特定のMRイメージングプロトコルで使用されるMichelle Yanによって開発されたプログラムのセット（Brainmask、Kmean_3dseg_ebeta）で構成されています。そして特に組織型への自動分割のための。これらのプログラムは、それらが特定のMRイメージングプロトコルに非常に効果的に示されていたが、それらは他のイメージングプロトコルに適応可能であることが証明されていない。したがって、それらが画像分析のためにBBLで大きく使用され続けるが、それらは新しい用途には推奨されない。おそらくクラップリングのバグを修正するため、またはより新しいPortable Programs.Bblimageのデータ交換を修正することを除いて、SEGMにさらに変更を加えることを期待していません。つまり、新しいアプリケーションのためのSEGMよりもSEGMよりも望ましい場合があります.imageファイルは、ネイティブアーキテクチャに関係なく、常に大きな順序で読み書きされます。これは、BBLのほとんどまたは全部がSPARCワークステーションに生成されて保存されているために行われ、常にデータfilesを変換するよりもこのフォーマットを読み取って書き込むことは、すべてのPlatformsにプログラムを読み取ることが簡単なように見えました.SEGMはSPARCの場合は、Intel、Solaris 2.7用のRed Hat Linux 6.2の下で静かにコンパイルして実行されています。 （現在のバージョンでは、SunのCCコンパイラの下で共有ライブラリをコンパイルする方法を正確に把握する時間があったため、GCCコンパイラが必要ではありません。）他の成功や失敗について聞くことに興味があります。他のマシンやオペレーティングシステムで成功するような修正。BBLIMAGEとSEGMの両方をインストールしている場合は、最初にSEGMをインストールしてからBBLIMAGEをインストールする必要があります。これら2つのパッケージ間で共有されているインストールされているファイルがいくつかあり、BBLIMageは最も最近のバージョンを持つ可能性が最も高いです。次のステップは通常十分です。 TARファイルとCDをソースツリーに解凍します.2。 "./configure"を実行すると、あなたのマシンの正しいパラメータが推測されます。デフォルトでは、 `/ usr / local / bin '、` / usr / local / man'、 `/ usrにパッケージのファイルをインストールします。 / local / lib '。オプション `--prefix = path 'を` configure'に与えることで、 `/ usr / local '以外のインストールプレフィックスを指定できます。たとえば、/ configure --prefix = / home / hughetttoのプログラムをインストールする/ home / hughett / bin / home / hughett / man、/ home / hughett / lib / 3の共有ライブラリーのプログラムをインストールしてください。 。 "make"を実行してすべてをコンパイルしてリンクします.4。プログラマーの場合は、EMACS用のタグファイルを作成するために "makeタグ"を実行してください。あなたがVI Partisanであれば、Makefile First.5に明らかに変更を加えます。 rootとして、通常の実行可能なバイナリとマニュアルページ、通常/ usr / local / binと/ usr / local / manに "Make Install"を実行します。 （ファイルがインストールされているMakeFileコントロールのマクロプレフィックス。設定を確認して、設定を正しく推測していることを確認したいと思うかもしれません。）6。バイナリとマニュアルページの検索パス（通常はPATHとMANPATH）の検索パスを変更する必要があります.7。共有ライブラリlibsegm.soは$ prefix / libにインストールされています。共有ライブラリの検索パス（通常はLD_LIBRARY_PATH）にこのディレクトリを追加する必要があります。
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