 | indelExtractor.IndeleXtractorは、インデルのマスクに加えて異なるアライメントマスクを生成するアプリケーションです。 |
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indelExtractor. 説明
IndeleXtractorは、インデルのマスクに加えて異なるアライメントマスクを生成するアプリケーションです。 分子配列アラインメントは分子系統発生分析の基礎であり、それでも最も考慮された局面のうちの1つである。アラインメンテナンスは、整列させることが困難な位置を含みます（すなわち、eyeによって編集する可能性がある）ポジションを含みます。インデルスの識別と取り外しのためのインデルのマスクとそれらの周囲のあいまいなアライメント。アラインメントマスクは、「マスクされた」および/または「マスクされていない」位置を節約するために使用され、多くの異なるファイル形式にアラインメントの位置が節約されます.Indelextractorは、多くのシーケンスとアライメント入出力ファイルフォーマットを処理するためのBioPerlの電力と一般的なシーケンス処理と操作のために使用します。 。 IndelExtractorの強力なファイル形式の処理の結果として。シーケンスファイル形式の変換のために単にそれを使用することができます！ "Indelextractor"の主な機能はいくつかの主な機能です。取り扱いと操作したがって、多くのシーケンスとアライメントファイル形式がサポートされており、それらはファイル拡張子によって認識されます。 IndeleXtractorが正しいファイル形式を正確に決定できるようにするには、ファイル拡張子が互換性のあるファイル拡張子を持つ必要があります。・アラインメントマスク・IndeleXtractorは、Indelの識別と削除のタスクを自動化するのに役立つように開発されました。このために、インデルマスクが開発され、それによってアライメント内の各位置は、インデル（マスクされた領域）と（マスクされていない領域）の一部を形成した位置を特定するために、コンセンサススタイルシーケンスの文字によって表された。ただし、追加のマスクが利用可能になりました：不変、変数、およびコンセンサスマスク。マスクが生成されると、ファイルへのアライメント全体をファイルに保存するときに、サブアライメント（マスク/マスク位置）をファイルに保存するために、または追加情報として追加情報として、追加情報として（例えばNEXUS）として使用できます。・補助特徴・Indelextractorの特徴セットは、Clustalwを使用したシーケンスをインデレスラクター内から行って、NCBIデータベースに対して配列を吹き付ける能力を実現するために拡張されました。 IndeleXtractorの設定を介して入手可能であるためのオプション。
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