ドメインファインダー 蛋白質における動的ドメインの決定と特性化のための対話型プログラム
今すぐダウンロード

ドメインファインダー ランキングとまとめ

ドメインファインダー タグ

分析します タンパク質 タンパク質分析 タンパク質の特性化 タンパク質の決定 決定

ドメインファインダー 説明

蛋白質における動的ドメインの決定と特性化のための対話型プログラム DomainFinderは、2つの実験構造を比較することによって、または効率的な通常モード技術を単一の構造に適用することによって、大型タンパク質の集団運動を分析するための対話型プログラムです。数千残基までのタンパク質は、数分でデスクトップコンピュータ上で治療することができます。動的ドメインは、他の領域に対して本質的に剛体のように移動することができるタンパク質中の領域である。すべてのタンパク質は動的ドメインを持っているが、それらがそうであれば、ドメインの相対的な動きは通常タンパク質の機能に関連している。したがって、動的ドメインの同定はタンパク質の機能を理解するのに有用である。しかし、動的ドメインの知識が役立つ他の状況があります。構造決定において、ドメインファインダーは、結晶パッキング、リガンド、または他の外部の影響が重要な立体構造変化をもたらし得るかどうかを容易に予測するのを助けることができる。タンパク質工学は、与えられた修正がの動的挙動を変える可能性があるかどうかを示すことができる。タンパク質。タンパク質運動の実験的観察では、それは特に関心のある地域を示唆することができる。数値シミュレーションでは、正しいサンプリングが検証されなければならないスローモーションを指摘します.DomainFinderは、科学的計算の要求に特に適した高レベルのオブジェクトプログラミング言語であるPythonで書かれています。スピードクリティカルな部分はC.一般的な操作のために、分子モデリングツールキット、分子モデリングおよびシミュレーションアプリケーションのためのPythonコードのライブラリーを利用する。ドメイン分析の結果は、すべての詳細をMMTKデータファイル内のすべての詳細で保存できます。これにより、あらゆる種類のさらなる分析ができます。 "DomainFinder"の主な機能は次のとおりです。 ・計算効率：数分でデスクトップコンピュータを使用して大きなタンパク質でさえ分析することができます ・使いやすさ：最先端のグラフィカルユーザインタフェース ・可視化とさらなる分析の結果のエクスポート（VRML、PDB、およびMMTKオブジェクト形式）

ドメインファインダー 関連ソフトウェア