創世記 遺伝子発現実験の全セットを同時に視覚化し分析するためのツールのプラットフォーム独立したJavaパッケージ
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同時に遺伝子発現実験の全セットを同時に可視化し分析するためのツールのプラットフォーム独立したJavaパッケージ 高スループット遺伝子発現分析は、生物医学研究の多くの分野でますます重要になっています。 cDNAマイクロアレイ技術は、高スループット分析のための非常に有望なアプローチであり、そしてゲノムスケールで遺伝子発現パターンを研究する機会を与える。顕微鏡スライド上に数千以上の遺伝子をスポットすることができ、各遺伝子の相対的発現レベルは、アレイにハイブリダイズした標識mRNAの蛍光強度を測定することによって決定することができる。したがって、マイクロアレイを使用して、2つのサンプル中の差次的に発現された遺伝子を大規模に同定することができる。差次的に発現された遺伝子の単純な識別を超えて、機能的注釈（会合副協会）または診断分類は、複数の実験からの遺伝子の同様の発現パターンを有する群へのクラスタリングを必要とする。いくつかのクラスタリング技術が最近開発され、マイクロアレイデータを分析するために適用された。フラットファイルからのデータを読み取ることを可能にする。滲み率は、さらなる統計分析のためにデータの最良の表現を得るために、いくつかの方法で正規化することができる。 1）階層的クラスタリング2）k平均3）自己組織化マップ4）主成分分析と5）サポートベクトルマシンをサポートするベクトルマシンをサポートするベクトルマシンをサポートする単純なピアソン相関から相互情報のようなより洗練されたアプローチまでの範囲の類似距離測定の測定が実施されてきた。また、遺伝子発現データを染色体配列にマッピングすることが可能である。柔軟性、さまざまな分析ツールとデータの視覚化、および研究界への無料の可用性は、このソフトウェアを将来の機能的なゲノム研究で貴重なツールをスイートにします。要件： ・Java. 制限事項 ・30日間の裁判このリリースでは新機能： ・カラーオプションシングル/ダブルの動作 ・フィルタオプション変動係数を追加しました ・Genesis Server Jobsの照会を施すことに関する問題 ・クラスタリング結果の表示における多数のバグ修正と改善点

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