clgo

遺伝子の大規模クラスターに非冗長な生物学的項を可視化するサイトスケーププラグイン
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Shareware
  • 価格:
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  • 出版社名:
  • ClueGO Team
  • 出版社のWebサイト:
  • http://genome.tugraz.at/cluego/cluego_description.shtml
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X
  • ファイルサイズ:
  • 52.8 MB

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clgo 説明

遺伝子の大規模クラスターに非冗長な生物学的項を可視化するサイトスケーププラグイン ClueGoは、機能的にグループ化されたネットワーク内の遺伝子のクラスターを研究し、それはゴロリア化と組み合わせて使用することができます。識別子は、テキストファイルからアップロードされたり、サイトコケのネットワークから対話的に対話できるようになります。サポートされている識別子の種類は、ユーザーによって簡単に拡張できます。 ClueGoは単一のクラスタ分析とクラスタの比較を実行します。使用されるオントロジーのソースから、用語は異なるフィルタ基準によって選択されます。同様の関連遺伝子を共有する関連用語は、冗長性を低下させるために融合することができます。 ClueGoネットワークはKAPPA統計で作成され、関連する遺伝子の類似性に基づいて用語間の関係を反映しています。ネットワーク上では、ノード色を機能グループとクラスタ分布との間で切り替えることができます。 Cluegoチャートは、特異性と生物学的役割の一般的な側面の根底にある。用語とグループの重要性が自動的に計算されます。 ClueGoは、遺伝子オントロジーの要件から最新のファイルで簡単に更新できます。 ・Java.


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