| g g 遺伝子ネットワークアルゴリズムのためのリアルなシリカベンチマークを生成するためのJavaツール |
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遺伝子ネットワークアルゴリズムのためのリアルなシリカベンチマークを生成するためのJavaツール GeneNetWeaver(GNW)は、遺伝子ネットワークリバースエンジニアリングアルゴリズムのためのリアルなシリコーベンチマークを生成するための使いやすいJavaツールです。 GNWを使用して、DREAM3をシリコの課題に生成した。リバースエンジニアリング方法の性能は、それらが適用されるネットワーク構造の種類に非常に敏感である可能性があることがよく知られている(例えば、メソッドがErds-Rnyネットワーク上でうまく機能する可能性がある。スケールフリーネットワークで失敗する)。したがって、方法の公正な比較のためには、ベンチマークネットワークが現実的な構造を有することが重要である。生物学的インタラクションネットワーク参考文献現実的なネットワーク構造を生成した後、次の質問は、適切な動的モデルを使用してこれらのネットワークから現実的なデータを生成する方法です。以前のin Silico Benchmarks(例えば、Mendesら)では、この目的のために比較的単純な現象論的モデルを使用した。要件: ・Java.
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