ロゴバル

このツールを使用してタンパク質配列ロゴを表示します。
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ロゴバル ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 出版社名:
  • Thomas BYrglin
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 115 KB

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ロゴバル 説明

Logobarは、タンパク質シーケンスのロゴを見るのを助けるために特別に設計された便利な、使いやすいソフトウェアです。 このアプリケーションでは、独自のコンピュータ上の複数のシーケンスアラインメントからタンパク質シーケンスロゴを生成でき、複数の配列アラインメントのすべての位置でアミノ酸の発生率を示す追加の出力ファイルが得られます。 主な特徴: 特定の位置の残基の周波数は色付きのバーで表されます。 アミノ酸は、ユーザ自身の選択肢に従って(例えば、同じグループ内に同様のアミノ酸を有する)群に配置することができる。 バーはグループに従って分類することができ、そのため、同様のアミノ酸を棒グラフに一緒に配置する。 ギャップは考慮され、ロゴにも表示されます。 ロードされた複数のシーケンスの配置でのパラメータの変更は、LogObarがローカルコンピュータ上で実行されているJavaアプリケーションであるため、迅速に視覚化されます。


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